Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CCDC6Q16204 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CCDC6Q16204 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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