Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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DDX39BQ13838 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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DDX39BQ13838 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DDX39BQ13838 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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