Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNH2Q12809 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms