Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms