Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms