Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC130P13994 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC130P13994 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms