Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LYL1P12980 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms