Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGA3P0DJD8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms