Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VTNP04004 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VTNP04004 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VTNP04004 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VTNP04004 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms