Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SOBPA7XYQ1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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