Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB5A4FU69 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms