Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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