Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC23Q9UJX2 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms