Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms