Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms