Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL11Q9NVR0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms