Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CNPPD1Q9BV87 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CNPPD1Q9BV87 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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