Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA3CQ99985 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA3CQ99985 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEMA3CQ99985 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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