Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNF148Q8N7C7 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNF148Q8N7C7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms