Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC84Q86UT8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms