Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C8A-201ENST00000361249 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf220-202ENST00000521244 2577 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CU633980.1-201ENST00000613894 1708 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GAPDHP72-202ENST00000636791 2141 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TPTE-205ENST00000622113 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF574-201ENST00000222339 3309 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 STK16-204ENST00000409638 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EBF2-201ENST00000408929 1888 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02267-201ENST00000513393 1687 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms