Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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