Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDK5R2Q13319 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R2Q13319 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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