Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms