Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMPOP42166 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMPOP42166 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMPOP42166 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMPOP42166 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMPOP42166 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMPOP42166 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPOP42166 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPOP42166 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPOP42166 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPOP42166 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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