Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms