Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEBLO76041 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.4 ms