Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms