Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QRK9 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QRK9 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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