Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf172C9J069 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms