Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms