Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms