Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00312Q9Y6C7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00312Q9Y6C7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms