Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX9Q9Y5X1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX9Q9Y5X1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX9Q9Y5X1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms