Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms