Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KNSTRNQ9Y448 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KNSTRNQ9Y448 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KNSTRNQ9Y448 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KNSTRNQ9Y448 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KNSTRNQ9Y448 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms