Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED3Q9Y3Q3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED3Q9Y3Q3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms