Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9Y3F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9Y3F1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms