Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COQ4Q9Y3A0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COQ4Q9Y3A0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms