Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
R3HDM2Q9Y2K5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
R3HDM2Q9Y2K5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms