Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFR2Q9UP52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFR2Q9UP52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFR2Q9UP52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms