Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH7Q9ULB5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH7Q9ULB5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH7Q9ULB5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH7Q9ULB5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH7Q9ULB5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH7Q9ULB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH7Q9ULB5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH7Q9ULB5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH7Q9ULB5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH7Q9ULB5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms