Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms