Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RCAN3Q9UKA8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RCAN3Q9UKA8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RCAN3Q9UKA8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms