Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCTN4Q9UJW0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN4Q9UJW0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms