Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX4Q9UIU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIX4Q9UIU6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIX4Q9UIU6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms