Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLCO3A1Q9UIG8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLCO3A1Q9UIG8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms