Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NUFIP1Q9UHK0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUFIP1Q9UHK0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms