Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNQ9P2M7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CGNQ9P2M7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CGNQ9P2M7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms