Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCOR3Q9P2K3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RCOR3Q9P2K3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms